醫療級次氯酸鈉溶于水可產生次氯酸。次氯酸是一種強氧化劑,能殺死水里的細菌。在廢水處理中,也是常用的氧化劑中的一種。作為一種真正高效和廣譜以及安全的強力滅菌殺毒藥劑,它同水的親和性很好,能與水任意比互溶,它不存在液氯以及二氧化氯等藥劑的安全隱患,且其消毒效果被公認為和氯氣相當。也正是因為這一特點,所以其消毒效果好,投加準確,操作安全,使用方便,易于儲存,對環境無毒害,不存在跑氣泄漏,可以任意環境工作狀況下投加。

事實上醫療級次氯酸鈉廣泛用于包括自來水和中水以及醫院污水等等各種水體的消毒。其高效的氧化性能夠破壞氰根離子和苯環等,用作處理含氰廢水和一些工業重度污染廢水的高級氧化,還可以用于剝離設備及管道上附著的沾泥。在工業用水和飲用水處理領域中,加水稀釋,直接用耐腐蝕的泵加入水系統。次氯酸能對水中有臭味的無機物徹底氧化消除,使水得以徹底凈化。